GJD2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2N6A

Ідентифікатори

Символи

GJD2, CX36, GJA9, gap junction protein delta 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607058 MGI: 1334209 HomoloGene: 7734 GeneCards: GJD2

Реагує на сполуку

carbenoxolone, flufenamic acid, 1-Октанол^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• gap junction channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • щілинні контакти • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • connexin complex • мембрана
Біологічний процес	• потенціал дії • cell communication • cell-cell signaling • зір • chemical synaptic transmission • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57369


14617

Ensembl


ENSG00000159248


ENSMUSG00000068615

UniProt


Q9UKL4


O54851

RefSeq (мРНК)


NM_020660


NM_010290

RefSeq (білок)


NP_065711


NP_034420

Локус (UCSC)

Хр. 15: 34.75 – 34.75 Mb

Хр. 2: 113.84 – 113.84 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GJD2 (англ. Gap junction protein delta 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 321 амінокислот, а молекулярна маса — 36 093^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEWTILERL	LEAAVQQHST	MIGRILLTVV	VIFRILIVAI	VGETVYDDEQ
TMFVCNTLQP	GCNQACYDRA	FPISHIRYWV	FQIIMVCTPS	LCFITYSVHQ
SAKQRERRYS	TVFLALDRDP	PESIGGPGGT	GGGGSGGGKR	EDKKLQNAIV
NGVLQNTENT	SKETEPDCLE	VKELTPHPSG	LRTASKSKLR	RQEGISRFYI
IQVVFRNALE	IGFLVGQYFL	YGFSVPGLYE	CNRYPCIKEV	ECYVSRPTEK
TVFLVFMFAV	SGICVVLNLA	ELNHLGWRKI	KLAVRGAQAK	RKSIYEIRNK
DLPRVSVPNF	GRTQSSDSAY	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

Belluardo N., Trovato-Salinaro A., Mudo G., Hurd Y.L., Condorelli D.F. (1999). Structure, chromosomal localization, and brain expression of human Cx36 gene. J. Neurosci. Res. 57: 740—752. PMID 10462698 DOI:10.1002/(SICI)1097-4547(19990901)57:5<740::AID-JNR16>3.0.CO;2-Z
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kitano T., Liu Y.-H., Ueda S., Saitou N. (2004). Human-specific amino acid changes found in 103 protein-coding genes. Mol. Biol. Evol. 21: 936—944. PMID 15014171 DOI:10.1093/molbev/msh100

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Gap junction protein delta 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19154 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UKL4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані