HMGN2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | HMGN2, HMG17, high mobility group nucleosomal binding domain 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 163910 HomoloGene: 136792 GeneCards: HMGN2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleosomal DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Хроматин • міжклітинний простір • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 26.47 – 26.48 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HMGN2 (англ. High mobility group nucleosomal binding domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 90 амінокислот, а молекулярна маса — 9 393[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPKRKAEGDA | | KGDKAKVKDE | | PQRRSARLSA | | KPAPPKPEPK | | PKKAPAKKGE |
KVPKGKKGKA | | DAGKEGNNPA | | ENGDAKTDQA | | QKAEGAGDAK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Landsman D., McBride O.W., Bustin M. (1989). Human non-histone chromosomal protein HMG-17: identification, characterization, chromosome localization and RFLPs of a functional gene from the large multigene family. Nucleic Acids Res. 17: 2301—2314. PMID 2565024 DOI:10.1093/nar/17.6.2301
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Louie D.F., Gloor K.K., Galasinski S.C., Resing K.A., Ahn N.G. (2000). Phosphorylation and subcellular redistribution of high mobility group proteins 14 and 17, analyzed by mass spectrometry. Protein Sci. 9: 170—179. PMID 10739259 DOI:10.1110/ps.9.1.170
- Landsman D., Soares N., Gonzalez F.J., Bustin M. (1986). Chromosomal protein HMG-17. Complete human cDNA sequence and evidence for a multigene family. J. Biol. Chem. 261: 7479—7484. PMID 3754870
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4986 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P05204 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|