SIRPA

SIRPA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2JJS, 2JJT, 2UV3, 2WNG, 4CMM

Ідентифікатори
Символи SIRPA, BIT, CD172A, MFR, MYD-1, P84, PTPNS1, SHPS1, SIRP, Signal-regulatory protein alpha, signal regulatory protein alpha
Зовнішні ІД OMIM: 602461 MGI: 108563 HomoloGene: 7246 GeneCards: SIRPA
Онтологія гена
Молекулярна функція

• SH3 domain binding
• protein phosphatase binding
• GO:0005083 GTPase regulator activity
• protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion
• cell-cell adhesion mediator activity
• protein antigen binding
• protein tyrosine kinase binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• клітинна мембрана
• екзосома
• мембрана
• tertiary granule membrane
• ficolin-1-rich granule membrane
• integral component of plasma membrane
• cell surface

Біологічний процес

• адгезія клітин
• leukocyte migration
• neutrophil degranulation
• GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
• регуляція експресії генів
• cell migration
• positive regulation of cell-cell adhesion
• regulation of interferon-gamma production
• regulation of interleukin-1 beta production
• regulation of interleukin-6 production
• regulation of tumor necrosis factor production
• negative regulation of interferon-beta production
• negative regulation of interleukin-6 production
• negative regulation of tumor necrosis factor production
• heterotypic cell-cell adhesion
• monocyte extravasation
• negative regulation of nitric oxide biosynthetic process
• regulation of nitric oxide biosynthetic process
• negative regulation of JNK cascade
• negative regulation of inflammatory response
• negative regulation of phagocytosis
• positive regulation of phagocytosis
• GO:0048552 regulation of catalytic activity
• positive regulation of T cell activation
• cellular response to hydrogen peroxide
• negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• cellular response to lipopolysaccharide
• cellular response to interferon-gamma
• cellular response to interleukin-1
• cellular response to interleukin-12
• negative regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production
• negative regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production
• cell-cell adhesion
• negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response
• negative regulation of I-kappaB phosphorylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
140885
19261
Ensembl
ENSG00000198053
ENSMUSG00000037902
UniProt
P78324
P97797
RefSeq (мРНК)
NM_001040022
NM_001040023
NM_080792
NM_001330728
NM_001177646
NM_001177647
NM_001291019
NM_001291020
NM_001291021
NM_001291022
NM_007547
NM_001355158
NM_001355160
RefSeq (білок)
NP_001035111
NP_001035112
NP_001317657
NP_542970
NP_001171118
NP_001277948
NP_001277949
NP_001277950
NP_001277951
NP_031573
NP_001342087
NP_001342089
Локус (UCSC) Хр. 20: 1.89 – 1.94 Mb Хр. 2: 129.43 – 129.47 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SIRPA (англ. Signal regulatory protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 504 амінокислот, а молекулярна маса — 54 967[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEPAGPAPGRLGPLLCLLLAASCAWSGVAGEEELQVIQPDKSVLVAAGET
ATLRCTATSLIPVGPIQWFRGAGPGRELIYNQKEGHFPRVTTVSDLTKRN
NMDFSIRIGNITPADAGTYYCVKFRKGSPDDVEFKSGAGTELSVRAKPSA
PVVSGPAARATPQHTVSFTCESHGFSPRDITLKWFKNGNELSDFQTNVDP
VGESVSYSIHSTAKVVLTREDVHSQVICEVAHVTLQGDPLRGTANLSETI
RVPPTLEVTQQPVRAENQVNVTCQVRKFYPQRLQLTWLENGNVSRTETAS
TVTENKDGTYNWMSWLLVNVSAHRDDVKLTCQVEHDGQPAVSKSHDLKVS
AHPKEQGSNTAAENTGSNERNIYIVVGVVCTLLVALLMAALYLVRIRQKK
AQGSTSSTRLHEPEKNAREITQDTNDITYADLNLPKGKKPAPQAAEPNNH
TEYASIQTSPQPASEDTLTYADLDMVHLNRTPKQPAPKPEPSFSEYASVQ
VPRK

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

  • Sano S., Ohnishi H., Kubota M. (1999). Gene structure of mouse BIT/SHPS-1. Biochem. J. 344: 667—675. PMID 10585853 DOI:10.1042/bj3440667
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Brooke G.P., Parsons K.R., Howard C.J. (1998). Cloning of two members of the SIRP alpha family of protein tyrosine phosphatase binding proteins in cattle that are expressed on monocytes and a subpopulation of dendritic cells and which mediate binding to CD4 T cells. Eur. J. Immunol. 28: 1—11. PMID 9485180 DOI:10.1002/(SICI)1521-4141(199801)28:01<1::AID-IMMU1>3.3.CO;2-M
  • Stofega M.R., Argetsinger L.S., Wang H., Ullrich A., Carter-Su C. (2000). Negative regulation of growth hormone receptor/JAK2 signaling by signal regulatory protein alpha. J. Biol. Chem. 275: 28222—28229. PMID 10842184 DOI:10.1074/jbc.M004238200
  • Hatherley D., Harlos K., Dunlop D.C., Stuart D.I., Barclay A.N. (2007). The structure of the macrophage signal regulatory protein alpha (SIRPalpha) inhibitory receptor reveals a binding face reminiscent of that used by T cell receptors. J. Biol. Chem. 282: 14567—14575. PMID 17369261 DOI:10.1074/jbc.M611511200

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9662 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P78324 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350