| SDC1 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 4GVC, 4GVD | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | SDC1, CD138, SDC, SYND1, syndecan, syndecan 1 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: SDC1 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • protein C-terminus binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • lysosomal lumen
• екзосома
• extracellular region
• integral component of membrane
• Golgi lumen
• integral component of plasma membrane
• мембрана
• cell surface
• клітинна мембрана
• external side of plasma membrane
• GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес | • glycosaminoglycan catabolic process
• canonical Wnt signaling pathway
• Загоєння ран
• response to calcium ion
• odontogenesis
• glycosaminoglycan biosynthetic process
• ureteric bud development
• response to cAMP
• positive regulation of exosomal secretion
• Sertoli cell development
• striated muscle cell development
• positive regulation of extracellular exosome assembly
• retinoid metabolic process
• response to glucocorticoid
• response to toxic substance
• response to organic substance
• response to hydrogen peroxide
• glycosaminoglycan metabolic process
• inflammatory response
• myoblast development
• leukocyte migration
• cell migration
• cytokine-mediated signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 2: 20.2 – 20.23 Mb | Хр. 12: 8.82 – 8.84 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SDC1 (англ. Syndecan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 32 462[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MRRAALWLWL | | CALALSLQPA | | LPQIVATNLP | | PEDQDGSGDD | | SDNFSGSGAG |
| ALQDITLSQQ | | TPSTWKDTQL | | LTAIPTSPEP | | TGLEATAAST | | STLPAGEGPK |
| EGEAVVLPEV | | EPGLTAREQE | | ATPRPRETTQ | | LPTTHLASTT | | TATTAQEPAT |
| SHPHRDMQPG | | HHETSTPAGP | | SQADLHTPHT | | EDGGPSATER | | AAEDGASSQL |
| PAAEGSGEQD | | FTFETSGENT | | AVVAVEPDRR | | NQSPVDQGAT | | GASQGLLDRK |
| EVLGGVIAGG | | LVGLIFAVCL | | VGFMLYRMKK | | KDEGSYSLEE | | PKQANGGAYQ |
| KPTKQEEFYA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kaukonen J., Alanen-Kurki L., Jalkanen M., Palotie A. (1997). The mapping and visual ordering of the human syndecan-1 and N-myc genes near the telomeric region of chromosome 2p. Hum. Genet. 99: 295—297. PMID 9050911 DOI:10.1007/s004390050360
- Subramanian S.V., Fitzgerald M.L., Bernfield M. (1997). Regulated shedding of syndecan-1 and -4 ectodomains by thrombin and growth factor receptor activation. J. Biol. Chem. 272: 14713—14720. PMID 9169435 DOI:10.1074/jbc.272.23.14713
- Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582
- Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004
- Lories V., Cassiman J.-J., van de Berghe H., David G. (1992). Differential expression of cell surface heparan sulfate proteoglycans in human mammary epithelial cells and lung fibroblasts. J. Biol. Chem. 267: 1116—1122. PMID 1339431
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10658 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P18827 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
Білки: кластери диференціації |
|---|
| | 1-50 | |
|---|
| | 51-100 | |
|---|
| | 101-150 | |
|---|
| | 151-200 | |
|---|
| | 201-250 | |
|---|
| | 251-300 | |
|---|
| | 301-350 | |
|---|
|
