DnaB helikaza
| Replikativna DNK helikaza | |
|---|---|
| Identifikatori | |
| Simbol | dnaB |
| Entrez | 948555 |
| UniProt | P0ACB0 |
| Ostali podaci | |
| EC broj | 3.6.1.- |
| N terminalni domen DnaB slične helikaze | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 NMR struktura N terminalnog domena E. coli DnaB helikaze | |||||||||
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | DnaB | ||||||||
| Pfam | PF00772 | ||||||||
| InterPro | IPR007693 | ||||||||
| SCOP | 1jwe | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1jwe | ||||||||
| |||||||||
| C terminalni domen DnaB slične helikaze | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | DnaB_C | ||||||||
| Pfam | PF03796 | ||||||||
| Pfam klan | CL0023 | ||||||||
| InterPro | IPR007694 | ||||||||
| |||||||||
DnaB helikaza je bakterijski enzim koji otvara replikacionu viljušku tokom replikacije DNK. Mehanizam kojim DnaB izvodi ATP hidrolizu radi translokacije duž DNK i denaturiše dupleks nije poznat. Promena kvaternarne strukture proteina koja obuhvata dimerizaciju N-terminusnog domena je uočena i moguće je da do nje dolazi tokom enzimskog ciklusa.[1] Kad se DnaB inicijalno veže za dnaA, on se asociara sa dnaC, negativnim regulatorom. Nakon DnaC disocijacije, DnaB se vezuje za dnaG.[2]
N-terminal ima multiheliksnu strukturu koja formira ortogonalni svežanj.[1] C-terminusni domen sadrži mesto vezivanja ATP-a.
Reference
- ^ а б Fass D, Bogden CE, Berger JM (1999). „Crystal structure of the N-terminal domain of the DnaB hexameric helicase”. Structure. 7 (6): 691—8. PMID 10404598.
- ^ Ya-Bin Lu; Pillarisetty V. A. L. Ratnakar; Bidyut K. Mohanty & Bastia, Deepak (1996). „Direct physical interaction between DnaG primase and DnaB helicase of Escherichia coli is necessary for optimal synthesis of primer RNA”. PNAS. 93 (23): 12902—12907.
Literatura
- Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X.
- Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036.
- Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
- Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097.
Spoljašnje veze
- DnaB+Helicases на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- p
- r
- u
i inicijacija
| Prokariotska (inicijacija) | |
|---|---|
| Eukariotska (priprema u G1 fazi) | Prereplikacioni kompleks: Kompleks prepoznavanja mesta početka (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) · Održavanje minihromozoma (MCM2 · MCM3 · MCM4 · MCM5 · MCM6 · MCM7) · CDC6 Autonomna replikaciona sekvenca Protein jednolančanog vezivanja (SSBP1, SSBP2, SSBP3, SSBP4) Primaza: PRIM1 · PRIM2 |
| Oba | Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) · Okazakijev fragment · Prajmer |
| Prokariotska (elongacija) | DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) · Replizom · DNK ligaza · DNK stega · Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment) |
|---|---|
| Eukariotska (sinteza u S fazi) | |
| Oba | Kretanje: Procesivnost · DNK ligaza |
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
Portali:
Molekularna i ćelijska biologija
Hemija
