CXCL13

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4ZAI, 5CBA, 5CBE

Ідентифікатори

Символи

CXCL13, ANGIE, ANGIE2, BCA-1, BCA1, BLC, BLR1L, SCYB13, C-X-C motif chemokine ligand 13

Зовнішні ІД

OMIM: 605149 MGI: 1888499 HomoloGene: 48431 GeneCards: CXCL13

Онтологія гена
Молекулярна функція	• receptor ligand activity • CCR10 chemokine receptor binding • cytokine activity • heparin binding • CXCR3 chemokine receptor binding • chemokine activity • protein heterodimerization activity • fibroblast growth factor binding • CXCR5 chemokine receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• chemokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • cell-cell signaling • germinal center formation • regulation of angiogenesis • хемотаксис • endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor • regulation of humoral immune response • cell surface receptor signaling pathway • response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • defense response to bacterium • negative regulation of endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor • positive regulation of T cell chemotaxis • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • inflammatory response • chronic inflammatory response • defense response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • lymphocyte chemotaxis across high endothelial venule • positive regulation of integrin activation • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin • B cell chemotaxis • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • neutrophil chemotaxis • leukocyte chemotaxis • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10563


55985

Ensembl


ENSG00000156234


ENSMUSG00000023078

UniProt


O43927


O55038

RefSeq (мРНК)


NM_006419 NM_001371558


NM_018866

RefSeq (білок)


NP_006410 NP_001358487


NP_061354

Локус (UCSC)

Хр. 4: 77.51 – 77.61 Mb

Хр. 5: 96.1 – 96.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXCL13 (англ. C-X-C motif chemokine ligand 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 109 амінокислот, а молекулярна маса — 12 664^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKFISTSLLL	MLLVSSLSPV	QGVLEVYYTS	LRCRCVQESS	VFIPRRFIDR
IQILPRGNGC	PRKEIIVWKK	NKSIVCVDPQ	AEWIQRMMEV	LRKRSSSTLP
VPVFKRKIP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10639 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O43927 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.