JAM2

JAM2
Идентификаторы
ПсевдонимыJAM2, C21orf43, CD322, JAM-B, JAMB, PRO245, VE-JAM, VEJAM, junctional adhesion molecule 2, IBGC8
Внешние IDOMIM: 606870 MGI: 1933820 HomoloGene: 10929 GeneCards: JAM2
Расположение гена (человек)
21-я хромосома человека
Хр.21-я хромосома человека[1]
21-я хромосома человека
Расположение в геноме JAM2
Расположение в геноме JAM2
Локус21q21.3Начало25,639,258 bp[1]
Конец25,717,562 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
16-я хромосома мыши
Хр.16-я хромосома мыши[2]
16-я хромосома мыши
Расположение в геноме JAM2
Расположение в геноме JAM2
Локус16|16 C3.3Начало84,571,011 bp[2]
Конец84,622,816 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • internal globus pallidus

  • subcutaneous adipose tissue

  • trigeminal ganglion
Наибольшая экспрессия в
  • interventricular septum

  • myocardium of ventricle

  • cumulus cell

  • cardiac muscles

  • stria vascularis
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
  • protein heterodimerization activity
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • межклеточные контакты
  • клеточная мембрана
  • часть клеточной мембраны
  • мембрана
  • bicellular tight junction
Биологический процесс
  • negative regulation of cell adhesion
  • extracellular matrix organization
  • leukocyte migration
  • cell-cell adhesion
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

58494

67374

Ensembl

ENSG00000154721

ENSMUSG00000053062

UniProt

P57087

Q9JI59

RefSeq (мРНК)

NM_001270407
NM_001270408
NM_021219

NM_023844

RefSeq (белок)

NP_001257336
NP_001257337
NP_067042

NP_076333

Локус (UCSC)Chr 21: 25.64 – 25.72 MbChr 16: 84.57 – 84.62 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

JAM2 (англ. Junctional adhesion molecule B, молекула адгезии плотных контактов B; CD322) — мембранный белок, молекула адгезии, локализованная в клеточных плотных контактах. Продукт гена человека JAM2[5][6][7].

Функции

Плотные контакты представляют собой один из способов межклеточной адгезии слоя эндотелиальных клеток. Они формируют непрерывный межклеточный контакт и физический барьер, который предотвращает проникновение растворённых веществ и воды через межклеточное пространство.

JAM2 относится к суперсемейству иммуноглобулинов и располагается в плотных контактах клеток высокого эндотелия венул. Белок играет роль адгезивного лиганда для взаимодействия с иммунными клетками и может участвовать в хоминге лимфоцитов во вторичных лимфоидных органах[7]. Может способствовать трансэндотелиальной миграции лимфоцитов[8]. Кроме этого, JAM2, как и JAM3, может быть вовлечён в поляризацию эндотелиальных клеток подобно белку PAR-3[9].

Взаимодействия

Взаимодействует с PARD3[9], с интегрином VLA-44β1).[10]

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000154721 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053062 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Palmeri D., van Zante A., Huang C.C., Hemmerich S., Rosen S.D. Vascular endothelial junction-associated molecule, a novel member of the immunoglobulin superfamily, is localized to intercellular boundaries of endothelial cells (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2000. — August (vol. 275, no. 25). — P. 19139—19145. — doi:10.1074/jbc.M003189200. — PMID 10779521.
  6. Cunningham S.A., Arrate M.P., Rodriguez J.M., Bjercke R.J., Vanderslice P., Morris A.P., Brock T.A. A novel protein with homology to the junctional adhesion molecule. Characterization of leukocyte interactions (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2000. — November (vol. 275, no. 44). — P. 34750—34756. — doi:10.1074/jbc.M002718200. — PMID 10945976.
  7. 1 2 Entrez Gene: JAM2 junctional adhesion molecule 2  (неопр.).
  8. Johnson-Léger C.A., Aurrand-Lions M., Beltraminelli N., Fasel N., Imhof B.A. Junctional adhesion molecule-2 (JAM-2) promotes lymphocyte transendothelial migration (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — October (vol. 100, no. 7). — P. 2479—2486. — doi:10.1182/blood-2001-11-0098. — PMID 12239159.
  9. 1 2 Ebnet K., Aurrand-Lions M., Kuhn A., Kiefer F., Butz S., Zander K., Meyer zu Brickwedde M.K., Suzuki A., Imhof B.A., Vestweber D. The junctional adhesion molecule (JAM) family members JAM-2 and JAM-3 associate with the cell polarity protein PAR-3: a possible role for JAMs in endothelial cell polarity (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 2003. — October (vol. 116, no. Pt 19). — P. 3879—3891. — doi:10.1242/jcs.00704. — PMID 12953056.
  10. Cunningham S.A., Rodriguez J.M., Arrate M.P., Tran T.M., Brock T.A. JAM2 interacts with alpha4beta1. Facilitation by JAM3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — August (vol. 277, no. 31). — P. 27589—27592. — doi:10.1074/jbc.C200331200. — PMID 12070135.

Литература

  • Muller W.A. Leukocyte-endothelial-cell interactions in leukocyte transmigration and the inflammatory response. (англ.) // Trends Immunol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 24, no. 6. — P. 327—334. — doi:10.1016/S1471-4906(03)00117-0. — PMID 12810109.
  • Bazzoni G. The JAM family of junctional adhesion molecules. (англ.) // Curr. Opin. Cell Biol.[англ.]. — Elsevier, 2004. — Vol. 15, no. 5. — P. 525—530. — doi:10.1016/S0955-0674(03)00104-2. — PMID 14519386.
  • Hattori M., Fujiyama A., Taylor T.D., etal. The DNA sequence of human chromosome 21. (англ.) // Nature. — 2000. — Vol. 405, no. 6784. — P. 311—319. — doi:10.1038/35012518. — PMID 10830953.
  • Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA cloning using in vitro site-specific recombination. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
  • Arrate M.P., Rodriguez J.M., Tran T.M., etal. Cloning of human junctional adhesion molecule 3 (JAM3) and its identification as the JAM2 counter-receptor. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 276, no. 49. — P. 45826—45832. — doi:10.1074/jbc.M105972200. — PMID 11590146.
  • Liang T.W., Chiu H.H., Gurney A., etal. Vascular endothelial-junctional adhesion molecule (VE-JAM)/JAM 2 interacts with T, NK, and dendritic cells through JAM 3. (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 168, no. 4. — P. 1618—1626. — doi:10.4049/jimmunol.168.4.1618. — PMID 11823489.
  • Gardiner K., Slavov D., Bechtel L., Davisson M. Annotation of human chromosome 21 for relevance to Down syndrome: gene structure and expression analysis. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2002. — Vol. 79, no. 6. — P. 833—843. — doi:10.1006/geno.2002.6782. — PMID 12036298.
  • Cunningham S.A., Rodriguez J.M., Arrate M.P., etal. JAM2 interacts with alpha4beta1. Facilitation by JAM3. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 31. — P. 27589—27592. — doi:10.1074/jbc.C200331200. — PMID 12070135.
  • Aurrand-Lions M., Johnson-Leger C., Lamagna C., etal. Junctional adhesion molecules and interendothelial junctions. (англ.) // Cells Tissues Organs (Print) : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 3. — P. 152—160. — doi:10.1159/000066967. — PMID 12476045.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Ebnet K., Aurrand-Lions M., Kuhn A., etal. The junctional adhesion molecule (JAM) family members JAM-2 and JAM-3 associate with the cell polarity protein PAR-3: a possible role for JAMs in endothelial cell polarity. (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — The Company of Biologists[англ.], 2004. — Vol. 116, no. Pt 19. — P. 3879—3891. — doi:10.1242/jcs.00704. — PMID 12953056.
  • Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., etal. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. (англ.) // Protein Sci.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 13, no. 10. — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Wiemann S., Arlt D., Huber W., etal. From ORFeome to biology: a functional genomics pipeline. (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2136—2144. — doi:10.1101/gr.2576704. — PMID 15489336. — PMC 528930.
  • Liu T., Qian W.J., Gritsenko M.A., etal. Human plasma N-glycoproteome analysis by immunoaffinity subtraction, hydrazide chemistry, and mass spectrometry. (англ.) // J. Proteome Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 6. — P. 2070—2080. — doi:10.1021/pr0502065. — PMID 16335952. — PMC 1850943.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400