HAP1

APEX1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1BIX, 1CQH, 4LND, 4QH9, 5DFF, 4QHD, 1E9N, 3U8U, 5DFI, 1HD7, 5DG0, 5DFJ, 4QHE, 5DFH, 1DE9, 4IEM, 2ISI, 1DE8, 2O3H, 1CQG, 1DEW, 5CFG

Identifiants
AliasesAPEX1
IDs externesOMIM: 107748 MGI: 88042 HomoloGene: 1241 GeneCards: APEX1
Position du gène (Homme)
Chromosome 14 humain
Chr.Chromosome 14 humain[1]
Chromosome 14 humain
Localisation génomique pour APEX1
Localisation génomique pour APEX1
Locus14q11.2Début20,455,191 bp[1]
Fin20,457,772 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 14 (souris)
Chr.Chromosome 14 (souris)[2]
Chromosome 14 (souris)
Localisation génomique pour APEX1
Localisation génomique pour APEX1
Locus14 C1|14 26.3 cMDébut51,162,425 bp[2]
Fin51,164,596 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • éminence ganglionnaire

  • ventricular zone

  • îlot de Langerhans

  • right adrenal gland

  • right adrenal cortex

  • left ovary

  • right ovary

  • left adrenal cortex

  • vésicule biliaire

  • rectum
Fortement exprimé dans
  • ligne primitive

  • artère carotide interne

  • artère carotide externe

  • paroi abdominale

  • Épiblaste

  • condyle

  • maxillary prominence

  • mandibular prominence

  • medial ganglionic eminence

  • embryon
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • activité nucléase
  • endonuclease activity
  • activité hydrolase
  • liaison ion métal
  • activité lyase
  • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
  • liaison de complexe macromoléculaire
  • liaison protéique
  • exonuclease activity
  • phosphodiesterase I activity
  • double-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity
  • endodeoxyribonuclease activity
  • chromatin DNA binding
  • endoribonuclease activity
  • uracil DNA N-glycosylase activity
  • phosphoric diester hydrolase activity
  • site-specific endodeoxyribonuclease activity, specific for altered base
  • double-stranded telomeric DNA binding
  • activité d'oxydoréductase
  • double-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity
  • transcription coactivator activity
  • NF-kappaB binding
  • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
  • damaged DNA binding
  • transcription corepressor activity
  • 3'-5' exonuclease activity
  • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
  • liaison ARN
  • class III/IV DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • centrosome
  • intracellulaire
  • mitochondrie
  • noyau
  • perinuclear region of cytoplasm
  • ribosome
  • transcription regulator complex
  • nuclear speck
  • nucléoplasme
  • nucléole
  • réticulum endoplasmique
Processus biologique
  • réparation de l'ADN
  • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis
  • cellular response to DNA damage stimulus
  • DNA recombination
  • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
  • negative regulation of smooth muscle cell migration
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • DNA demethylation
  • cellular response to cAMP
  • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
  • transcription, DNA-templated
  • response to organonitrogen compound
  • cellular response to hydrogen peroxide
  • cellular response to peptide hormone stimulus
  • regulation of mRNA stability
  • cellular response to organonitrogen compound
  • cell redox homeostasis
  • vieillissement
  • base-excision repair
  • maintien des télomères
  • negative regulation of nucleic acid-templated transcription
  • telomere maintenance via base-excision repair
  • regulation of apoptotic process
  • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

328

11792

Ensembl

ENSG00000100823

ENSMUSG00000035960

UniProt

P27695

P28352

RefSeq (mRNA)

NM_001244249
NM_001641
NM_080648
NM_080649

NM_009687

RefSeq (protéine)

NP_001231178
NP_001632
NP_542379
NP_542380

NP_033817

Localisation (UCSC)Chr 14: 20.46 – 20.46 MbChr 14: 51.16 – 51.16 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'HAP1 (pour « Huntingtin-associated protein 1 ») est une protéine codée par le gène du même nom situé sur la chromosome 17 humain.

Fonctions

Contrairement à la huntingtine, exprimée dans l'ensemble de l'organisme, l'HAP1 est produite exclusivement dans les neurones, se fixant sur les tubules et autres organelles et intervenant dans le transport de différents éléments[5]. Elle est essentiellement retrouvée dans les noyaux du tronc cérébral, le bulbe olfactif et les noyaux supraoptiques de l'hypothalamus[6].

Elle interagit avec la huntingtine normale permettant le transport de la BDNF ou (facteur neurotrophique dérivé du cerveau). Son absence (associée avec une hungtitine normale) donne des lésions cérébrales proches de la maladie de Huntington dans un modèle animal[7], entraînant des troubles du comportement avec une anorexie, probablement en lien avec l'acide γ-aminobutyrique (GABA)[8], et la mort[9].

Elle intervient dans la neurogenèse post natale en intervenant sur les récepteurs aux neurotrophines, du moins chez la souris[10].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100823 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000035960 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Rong J, Li SH, Li XJ, Regulation of intracellular HAP1 trafficking, J Neurosci Res, 2007;85:3025–3029
  6. Li XJ, Sharp AH, Li SH et al. Huntingtin-associated protein (HAP1): discrete neuronal localizations in the brain resemble those of neuronal nitric oxide synthase, Proc Natl Acad Sci U S A, 1996;3:4839–4844
  7. Li SH, Yu ZX, Li CL et al. Lack of huntingtin-associated protein-1 causes neuronal death resembling hypothalamic degeneration in Huntington’s disease, J Neurosci, 2003;23:6956–6964
  8. Sheng G, Chang GQ, Lin JY et al. Hypothalamic huntingtin-associated protein 1 as a mediator of feeding behavior, Nat Med, 2006;12:526–533
  9. Chan EY, Nasir J, Gutekunst CA et al. Targeted disruption of Huntingtin-associated protein-1 (Hap1) results in postnatal death due to depressed feeding behavior, Hum Mol Genet, 2002;11:945–959
  10. Xiang J, Yang H, Zhao T et al. Huntingtin-associated protein 1 regulates postnatal neurogenesis and neurotrophin receptor sorting, J Clin Invest, 2014;124:85–98
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